目标区域捕获测序是利用特制的探针对客户感兴趣的基因组区域进行富集后再进行测序的研究方法。通过该方法能够获得特定区域的遗传信息,极大地提高了基因组中特定区域的研究效率,显著降低了研究成本。从而帮助广大科研工作者筛选变异位点、识别和研究与疾病、种群进化相关的编码区域内的结构变异。您只需提供样本和候选区域,上海伯豪即可为您提供从探针定制、杂交、测序到生物信息分析的全面解决方案。
一、基于AmpliSeqTM 技术的序列捕获解决方案
Ampliseq捕获系统 + Ion Torrent PGM测序平台
Ion Torrent是最新一代的测序技术,它的问世给测序技术的应用带来了激动人心的进展。它采用了半导体技术和简单的化学试剂进行DNA测序,而不是使用光作为媒介。在半导体芯片的微孔中固定DNA链,随后依次掺入ATCG。随着每个碱基的掺入,释放出氢离子,在它们穿过每个孔底部时能被检测到,通过对H+的检测,实时判读碱基。
序列捕获测序能对基因组上某些特定的区域进行分析,但是传统的序列捕获测序技术操作复杂,实验时间长,且对DNA样品的数量要求较高。结合Ion Torrent测序仪, AmpliSeqTM技术通过超高多重PCR,只需低起始量样品,能够在一管中同时扩增几千种PCR片段,科学家们能够快速完成某些疾病相关基因的突变筛察。同时,本系统可还可以为有需要的科学家定制目标序列的多重PCR体系,快速完成检测流程。
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二、基于Agilent HaloPlex技术的序列捕获解决方案
HaloPlex 技术完美融合了聚合酶链反应系统的速度和特异性以及基于液相杂交体系的可扩展性和捕获片段大小的灵活性(捕获区域大小为1Kb-5Mb,推荐<500Kb区段设计)。该实验方案无需文库构建,利用单管操作,从而解决了多重 PCR 由于存在交叉杂交问题而使靶向序列数量受限的问题。
除了客户自己定制序列,HaloPlex还针对特定的疾病提供设计好的解决方案,目前有以下几种,如果研究者需要研究其他疾病,可以通过SureDesign来查看。
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三、基于Agilent SureSelect技术的序列捕获解决方案
Agilent SureSelect定制捕获可针对基因组的一小部分区段进行探针设计,从而大大降低测序及分析流程的复杂性。灵活的设计方式以及与各种高通量测序平台良好的对接能力,使得Agilent SureSelect定制捕获能够有效地满足科学家的各种定制要求。
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四、基于NimbleGen技术的序列捕获解决方案
NimbleGen SeqCap捕获系统采用advanced repeat masking方法设计探针,并在此基础上,利用实际测序数据再次进行平衡筛选,保证了很好的均一性(uniformity)和覆盖率(coverage),可以有效捕捉到每个靶向序列,从而对目标区域进行精确细致的分析,有效监测SNP突变。SeqCap可使用多至2.1M数量的探针进行捕获设计,产生可靠数据,降低成本,节约时间。
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上海伯豪生物技术有限公司拥有六大服务平台:生物样品分析平台、微阵列芯片平台、新一代测序平台、生物标志物平台、分子检测平台、生物信息平台,凭借高标准的技术平台和多样化的服务等竞争优势,公司向国内外企业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案。目前正在为多达18家跨国制药企业(包括排名前10位的跨国制药企业)和超过3000家的国内科研机构、医院等提供基因表达谱、基因分型、比较基因组学、DNA甲基化、miRNA、生物标志物筛选及确认、生物信息等技术服务。
公司拥有一支以上海为基础,辐射全国的强大市场营销队伍和销售网络,已设立华北、华南、华东三个大区十五个办事处,推广公司的主导技术服务、代理产品,快速提升公司品牌的知名度,扩大影响力。过去10年承接项目数超过10000个,用户单位3000家以上,协助客户发表SCI论文700余篇(影响因子共计3000多分),全面推动了中国基因组学服务产业的发展。
公司建立了规模化的质量控制体系,通过了ISO9001: 2008质量技术体系的认证,并参照GLP-L的标准,通过128个SOP文件对项目、样品、实验过程、生物信息分析过程、数据信息管理、保密等进行严格质控。尤其是数据管理,做到异地备份,保密管理。为用户的数据真实性、可靠性提供了保证。
公司的系统化技术平台和高质量的服务体系得到了广大客户认可和合作伙伴的高度评价。公司平台陆续获得了国际知名高通量技术厂商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技术服务中心认证。公司于2012年获得诺华(CNIBR)优秀供应商奖(Supplier Award 2012)。公司是Affymetrix公司在中国第一家认证的服务提供商,是Agilent公司在国内唯一认证的服务提供商,先后被授予“Agilent公司亚太区最佳服务供应商”和“Affymetrix公司优秀服务商”称号。
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上海伯豪生物技术有限公司拥有六大服务平台:生物样品分析平台、微阵列芯片平台、新一代测序平台、生物标志物平台、分子检测平台、生物信息平台,凭借高标准的技术平台和多样化的服务等竞争优势,公司向国内外企业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案。目前正在为多达18家跨国制药企业(包括排名前10位的跨国制药企业)和超过3000家的国内科研机构、医院等提供基因表达谱、基因分型、比较基因组学、DNA甲基化、miRNA、生物标志物筛选及确认、生物信息等技术服务。
公司拥有一支以上海为基础,辐射全国的强大市场营销队伍和销售网络,已设立华北、华南、华东三个大区十五个办事处,推广公司的主导技术服务、代理产品,快速提升公司品牌的知名度,扩大影响力。过去10年承接项目数超过10000个,用户单位3000家以上,协助客户发表SCI论文700余篇(影响因子共计3000多分),全面推动了中国基因组学服务产业的发展。
公司建立了规模化的质量控制体系,通过了ISO9001: 2008质量技术体系的认证,并参照GLP-L的标准,通过128个SOP文件对项目、样品、实验过程、生物信息分析过程、数据信息管理、保密等进行严格质控。尤其是数据管理,做到异地备份,保密管理。为用户的数据真实性、可靠性提供了保证。
公司的系统化技术平台和高质量的服务体系得到了广大客户认可和合作伙伴的高度评价。公司平台陆续获得了国际知名高通量技术厂商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技术服务中心认证。公司于2012年获得诺华(CNIBR)优秀供应商奖(Supplier Award 2012)。公司是Affymetrix公司在中国第一家认证的服务提供商,是Agilent公司在国内唯一认证的服务提供商,先后被授予“Agilent公司亚太区最佳服务供应商”和“Affymetrix公司优秀服务商”称号。
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